本病缺乏病因治疗，目前尚无法根治，现代医学主要是针对甲功异常和甲状腺肿大对症处理。如甲状腺功能正常，无需特殊治疗但要随诊；对于甲状腺功能减低者，应进行甲状腺激素替代治疗；桥本氏甲亢患者病程和炎性甲亢相同，多数不需治疗，经历甲亢期、甲亢正常期、甲减期和甲功正常期四个期，一过性甲亢给β受体阻滞剂对症处理即可；不支持常规用糖皮质激素治疗，对桥本氏甲状腺炎效果无大差别，但不良反应有库欣综合征、骨质疏松、电解质紊乱、肾上腺皮质功能抑制以及上消化道出血等；手术治疗仅在高度怀疑合并癌和淋巴瘤时或甲状腺肿大出现气管压迫症状，甲状腺激素替代治疗不能使其恢复正常采用，术后终生甲状腺激素替代治疗。